Characterization of Escherichia Coli Isolates from Patients with Urinary Tract Infections from Thabet Hospital-Tulkarm, Palestine
Article info
2014-06-18
2015-03-11
2016-03-03
31 - 52
Keywords
- Integrons
- UPEC
- Phylogenetic groups
- E. coli
- antibiotic resistance scores
- Palestine.
Abstract
This study aimed to analyze phylogenetic groups, the presence of class I, II, III integrons and resistance phenotype in a collection of fifty E. coli strains isolated from urine specimens obtained from suspected cases with urinary tract infections at Thabet Hospital, During May-December 2012. The antibiotic susceptibility testing for these isolates was done by disk diffusion method. The phylogenetic groups and class I, II and III integrons were determined by multiplex PCR. Statistical analysis was done by using Mann-Whitney U-Test (Two-tailed), Chi-square (χ2) test or Fisher exact test. The results showed that 36 (72%) of the studied strains, belonged to group D, 13 (26%) strains to group A, and 1 (2%) strain belonged to group B1. Twenty one (42%) of E. coli strains carried class I integrons. Prevalence of class I integrons in group D and group A was 44.4% and 30.8%, respectively. There was no significant difference in the mean of antibiotic resistance score for strains belonged to group D and carried class I integrons and those belonged to group A and harbored the same integron class. Antibiotic resistance has ranged from 24% for Gentamicin to 100% for Cefazolin and Erythromycin. There is a significant difference in the mean of antibiotic resistance scores for strains belonged to group D (8.4) and group A (6.5) (P = 6.2 x 10-4). Results showed that 2 large clusters depend on resistance/sensitive of strains to fluoroquinolones. Association of Trimethoprim/Sulphamethoxazole resistance with the D group showed statistically significant difference (P < 0.05) compared to group A. In conclusion, molecular analysis of 50 E. coli urine isolates exhibited a greater prevalence of class I integrons, a greater prevalence of phylogenetic group D, which possessed a higher resistance scores than group A. Urinary tract infections caused by such strains represent a clinical problem because of limited therapeutic options.These articles may interest you also
- Biological Effect of Two Strains of Microorganisms Antagonistic to Botrytis Cinerea Causal Organism of Gray Mold on Strawberry
- Potential Biocontrol Agents on Nutsedges
- Comparison of Milk Yield and Reproductive Performance of Sheep Breeds in the West Bank, Palestine
- Medicinal Plant Diversity in the Flora of Gaza Valley, Gaza Strip, Palestine
- Control of Alternaria Spot Disease on Loquat (Eriobotrya japonica Lindl.) Using Detached Fruits and Leaf-disk Assay
- The Effect of Using Citrus Wood Charcoal in Broiler Rations on the Performance of Broilers
- Use of Saccharomyces Cerevisiae In Biological Treatment for Heavy Metals Uptake from Industrial Wastewater
- Threshold Models in the Palestinian Folklore Song (Bukra Al-Eid Whenaied) Song (Tomorrow Is A Feast) As A Model
- Finite Element Analysis of Hyperbolic Paraboloid Groined Vault Structure
- The Role of Social Communication Networks in Mobilizing The Palestinian Public Opinion Toward Socio-Political Change
توصيف الإشريكية القولونية المعزولة من المرضى الذين يعانون من التهابات المسالك البولية في مستشفى ثابت- طولكرم- فلسطين
معلومات المقال
2014-06-18
2015-03-11
2016-03-03
31 - 52
الكلمات الإفتتاحية
- Integrons
- UPEC
- Phylogenetic groups
- E. coli
- antibiotic resistance scores
- Palestine.
الملخص
هدفت هذه الدراسة إلى تحليل المجموعات التطورية، وإيجاد المجموعة الأولى والثانية والثالثة للانتجرونات (integrons) والبحث عن مقاومة الإشريكية القولونية للمضادات الحيوية، في خمسين عينة معزولة من البول، والتي تم الحصول عليها من الحالات المشتبه فيها بوجود التهابات للمسالك البولية في مستشفى ثابت، خلال شهر أيار إلى كانون الأول .2012 وتم إجراء فحص الحساسية للمضادات الحيوية لهذه السلالات عن طريق انتشار القرص. المجموعات التطورية والمجموعة الأولى والثانية والثالثة للانتجرونات تم تحديدها باستخدام تقنية سلسلة تفاعل البلمرة المتعدد(Multiplex PCR) . وقد تم إجراء التحليل الإحصائي باستخدام اختبار مان ويتني U- (Mann-Whitney U-Test)، مربع كاي (χ2) أو اختبار فيشر الدقيق .(Fisher exact test) وأظهرت النتائج أن 36 (%72) من هذه السلالات تنتمي إلى مجموعةD ، و (26%)من السلالات 13 تنتمي إلى المجموعة (A)، في حين تنتمي إحدى السلالات (2%) إلى المجموعة .(B1) وكانت إحدى وعشرون (42%) من سلالات الإشريكية القولونية تحمل المجموعة الأولى للانتجرونات، 44.4٪ من سلالات المجموعة (D) و30.8٪ من سلالات المجموعة (A)كانت تحمل المجموعة الأولى للانتجرونات. وأظهرت النتائج أيضاً أنه لا يوجد فرق إحصائي معنوي في متوسط سجل النقاط لمقاومة المضادات الحيوية للسلالات التي تنتمي إلى مجموعة(D) وتحمل المجموعة الأولى للانتجرونات والمجموعة (A)التي تحمل نفس مجموعة الانتجرونات. وتراوحت المقاومة للمضادات الحيوية من 24٪ للجنتاميسين إلى 100٪ لسيفازولين والاريثروميسين. وتبين أن هناك فرقاً كبيراً في متوسط سجل النقاط لمقاومة المضادات الحيوية للسلالات التي تنتمي إلى مجموعة (8.4) DوالمجموعةA (6.5) .(P = 6.2 × 10-4) أظهرت النتائج في مخطط الشجرة(Dendrogram) تكون مجموعتين كبيرتين تعتمدان على المقاومة/الحساسية لسلالات الإشريكية القولونية لفلوروكينولونات، وكان ارتباط مقاومة العزلات لمضاد ميثوبريم- السلفاميثوكسازول مع المجموعة(D) ذا فرق معنوي إحصائي مقارنة مع عزلات المجموعة (A) .(P <0.05) وأظهر التحليل الجزيئي ل50 من سلالات الإشريكية القولونية انتشاراً عالياً للمجموعة الأولى للانتجرونات، وارتفاعاً في نسبة انتشار المجموعة التطورية (D)، وارتفاعاً في متوسط سجل النقاط لمقاومة المضادات الحيوية للسلالات التي تنتمي إلى مجموعة .(D) وصفوة القول أن التهابات المسالك البولية التي تسببها مثل هذه السلالات تمثل مشكلة سريرية بسبب الخيارات العلاجية المحدودة.These articles may interest you also
- التأثير البيولوجي لسلالتين من الكائنات الحية الدقيقة المضادة للفطر المسبب لمرض العفن الرمادي في التوت الأرضي/ الفراولة
- Potential Biocontrol Agents on Nutsedges
- مقارنة إنتاجية الحليب والكفاءة التناسلية لسلالات الأغنام في الضفة الغربية - فلسطين
- تنوع النباتات الطبية في فلورا منطقة وادي غزة- قطاع غزة- فلسطين
- Control of Alternaria Spot Disease on Loquat (Eriobotrya japonica Lindl.) Using Detached Fruits and Leaf-disk Assay
- اثر استخدام فحم الحمضيات في العلف على أداء صيصان اللحم
- استعمال خميرة الخبز في المعالجة الحيوية لإزالة المعادن الثقيلة من مياه الصرف الصناعي
- النماذج البدئية في الأغنية الشعبية الفلسطينية أغنية (بكره العيد وبنعيد) نموذجاً
- استخدام نظرية العناصر المحددة في حل منشأ على شكل قبو ملتوي
- دور شبكات التواصل الاجتماعي في تعبئة الرأي العام الفلسطيني نحو التغيير الاجتماعي والسياسي - دراسة وصفية تحليلية
An-Najah National University
Nablus, Palestine
Nablus, Palestine
- P.O. Box
- 7, 707
- Fax
- (970)(9)2345982
- Tel.
- (970)(9)2345560
- (970)(9)2345113/5/6/7-Ext. 2378
- [email protected]
- Dean
- Prof. Rowa Ramahi